Les restes d'une espario de mammut de 1,1 million d'années ont permis de reconstruire les génomes partiels d'un pathogène, qui représente l'ADN microbien associé à un hôte plus âgé.
Les analyses effectuées par une équipe de chercheurs dirigée par l'Université de Stockholm ont également permis que plusieurs microbes soient trouvés dans des restes de mammouths qui «étaient probablement associés à des processus pathogènes» chez ces animaux.
Cela a été expliqué à Efe au chercheur David Díez del Molino, du centre paléogénétique de l'Université de Stockholm et l'un des signataires de l'étude dans laquelle le paléontologue espagnol Juan Luis Arsuaga a participé, entre autres.
L'article publié par Cell a analysé la présence de microbes associés aux restes de 483 spécimens de mammouth tout au long de l'évolution de l'espèce, dont 440 n'avaient pas été étudiés auparavant.
L'équipe a utilisé des techniques avancées de génomique et de bioinformatique pour distinguer les microbes qui vivaient à côté des mammouths de ceux qui ont envahi leurs restes après leur mort.
Les résultats «ouverts», ont déclaré Díez, «la possibilité d'analyser et de comprendre la relation des espèces éteintes avec des microbes et des agents pathogènes qui pourraient influencer à la fois leur évolution et le processus d'extinction».
Les génomes des microbes évoluent rapidement, de sorte que « l'obtention de données ADN fiables de plus d'un million d'années a été comme suivre une trace qui a constamment réécrit », a-t-il expliqué dans un communiqué Tom Van der Walk, de l'Université de Stockholm et également signataire de l'étude.
Lorsque l'ADN est plus âgé, il est plus compliqué de trouver des microbes à proximité présents les génomes présents aujourd'hui, mais l'équipe a pu identifier six «potentiellement liés à un hôte animal», a déclaré Diez.
Ils ont été placés dans l'arbre phylogénétique avec leurs parents actuels et vérifiés s'ils étaient associés à des agents pathogènes connus similaires aujourd'hui.
Parmi les six groupes microbiens constamment associés avec des mammouths hôtes figuraient des parents actinobacillus, pasteurella, streptococcus et erysipothrix.
Une bactérie liée à Pasteurella, identifiée dans l'étude, est étroitement liée à un agent pathogène qui a provoqué des épidémies mortelles chez les éléphants africains.
Étant donné que les éléphants africains et asiatiques sont les parents les plus vivants de mammouths, ces résultats soulèvent la question de savoir si des mammouths auraient également pu être vulnérables à des infections similaires.
L'équipe a reconstruit les génomes partiels des bactéries Erysipelothrix d'un mammouth de 1,1 million d'années, qui représente l'ADN microbien associé à un hôte plus âgé jamais récupéré.

(Agence EFE)
Bien qu'il soit difficile de déterminer l'impact exact des microbes identifiés dans la santé des mammouths en raison de la dégradation de l'ADN et des données comparatives limitées, l'étude offre une vision sans précédent des microbiomes de la mégafaune éteinte.
Les résultats suggèrent que certaines lignées microbiennes coexistaient avec ces animaux pendant des centaines de milliers d'années, couvrant de grandes zones géographiques et des échelles temporelles évolutives, pendant plus d'un million d'années jusqu'à l'extinction des dame mammouths sur l'île de Wrangel il y a environ 4000 ans.
Les restes anciens peuvent conserver des informations biologiques qui vont bien au-delà du génome de l'hôte, offrant des perspectives sur la façon dont les microbes ont influencé l'adaptation, les maladies et l'extinction dans les écosystèmes du Pléistocène, a déclaré Van der Valk.
Jusqu'à présent, ce type d'études était essentiellement axé sur les humains anciens. Dans ce cas, les cas les plus anciens d'ADN de bactéries trouvés seraient deux de Corynebacterium diphtheriae (cause de diphtérie) datée d'il y a 11 000 ans, a déclaré Díez.





