Une équipe internationale a séquencé le premier génome de référence de haute qualité de l'arganier (Argania spinosa), un arbre endémique du Maroc, grâce à des techniques scientifiques avancées dans une étude publiée dans la revue Nature.
La recherche a été menée par l'Institut national de recherche agronomique du Maroc avec l'Université Mohammed V, le Centre international d'agriculture saline de Dubaï, la Texas Tech University et le Centre international de recherche agricole en zones arides (ICARDA).
Le génome d’un spécimen « TAGUERTE (S7P2) » à Taguert, dans la province sud de Tiznit, favorisera la conservation et l’amélioration génétique de cet arbre pour une plus grande productivité et résistance.
La stratégie agricole actuelle du Maroc, appelée Plan Génération Verte 2020-2030, vise à doubler la production d'huile d'argan à 10 000 tonnes, à planter 50 000 nouveaux hectares et à réhabiliter 400 000 hectares supplémentaires là où l'arbre est déjà planté.
L’équipe de recherche a utilisé les techniques PacBio HiFi pour les lectures longues d’ADN, Hi-C pour la structure des chromosomes et le séquençage d’ARN des feuilles, des racines et des graines pour annoter les gènes.
PacBio HiFi est une technique permettant de lire l'ADN en longs morceaux avec une précision presque parfaite (plus de 99,9 %) pour déterminer l'ordre exact des nucléotides, tandis que Hi-C est une technique qui montre comment l'ADN est replié et organisé en 3D à l'intérieur de la cellule.
Cependant, RNA-seq analyse l’ARN (copie active des gènes) des feuilles, des racines et des graines pour identifier quels gènes sont actifs, où et quelles combinaisons la cellule utilise pour fonctionner. Toutes ces techniques ont permis de construire une carte génétique quasi complète de l’arganier.
L'arganier, seul représentant de la famille des Sapotacées en Afrique du Nord et protégé par l'UNESCO sur les pentes du Haut et de l'Anti Atlas marocain, fournit des fruits alimentaires, du fourrage et de l'huile de ses graines, clé contre la désertification.
Leurs populations sont en déclin depuis le XIXe siècle en raison du changement climatique, de la surexploitation et de la pression démographique.
